Các bo mạch chủ GIGABYTE series 9 sử dụng thiết kế tản nhiệt mới có tác dụng làm mát cực kỳ hiệu quả trên những khu vực quan trọng của bo mạch như nguồn CPU và chipset (PCH). Bo mạch chủ GIGABYTE series 9 hỗ trợ làm mát khu vực cấp nguồn quan trọng thậm chí khi sử dụng cấu hình tải cực nặng vẫn giữ được nhiệt độ tối ưu.

Nhiều nhà sản xuất hệ thống tản nhiệt nước hiện nay yêu cầu khu vực cấp nguồn cho quạt CPU phải hỗ trợ cả hai đầu cắm nguồn cho quạt làm mát và thiết bị bơm. Trước yêu cầu đó, GIGABYTE đã tích hợp cho các bo mạch chuyên ép xung của mình đầu cấp nguồn OPT fan, đây là đầu cắm bổ sung dùng để cấp nguồn cho hệ thống bơm nước và được cấu hình để hoạt động ở mức tối đa. Ngoài ra, OPT fan còn có ích khi sử dụng hệ thống làm mát 2 quạt hiệu suất cao.